وتُستخدم في هذه الدراسات تقنيات التحليل الجزيئي، ومنها تسلسل جين 16S rRNA وتقنيات التسلسل الميتاجينومي (Metagenomic Sequencing)، للكشف عن التنوع البكتيري وتحديد الاختلافات في تركيب المجتمعات الميكروبية. ويمكن دمج النتائج مع التحاليل الفيزيائية والكيميائية التقليدية للتربة للحصول على تقييم أكثر شمولاً. فعلى سبيل المثال، إذا عُثر على تربة عالقة بحذاء أحد المشتبه بهم، فقد تكشف المقارنة الميكروبية عن تشابه بينها وبين التربة الموجودة في موقع الجريمة. إلا أن هذا التشابه لا يثبت بمفرده وجود الشخص في الموقع، لأن مجتمعات ميكروبية متشابهة قد توجد في مواقع متعددة، كما أن التلوث والظروف البيئية قد يؤثران في النتائج. وتبرز أهمية هذا المجال في الجرائم التي تتضمن نقل الجثث أو إخفاء الأدلة أو انتقال الأشخاص والمركبات بين مواقع مختلفة. ومع ذلك، فإن استخدام البصمات الميكروبية للتربة في تحديد المواقع الجغرافية ما يزال بحاجة إلى دراسات تحقق واسعة وإجراءات تحليلية موحدة لضمان موثوقية النتائج