تؤدي الوراثة الجنائية دورًا مهمًا في تحديد هوية الأشخاص المفقودين، خصوصًا عندما لا تتوفر وسائل تعريف تقليدية كافية. ويعتمد هذا المجال على مقارنة DNA المستخلص من عينات مجهولة مع عينات مرجعية من الشخص المفقود أو من أقاربه البيولوجيين. يمكن الحصول على عينات مرجعية من بعض الممتلكات الشخصية التي تحتوي على مادة بيولوجية مناسبة، أو من أفراد الأسرة. وتُستخدم العينات العائلية لدراسة العلاقات الوراثية وإجراء المقارنات الإحصائية. وقد يكون تحليل DNA النووي، أو في بعض الحالات DNA الميتوكوندري، مفيدًا في هذه العملية. تزداد أهمية الوراثة الجنائية عند العثور على رفات بشرية مجهولة. إذ يمكن مقارنة الملف الوراثي للرفات مع عينات أفراد الأسرة لتقييم العلاقة البيولوجية. ويساعد ذلك في الوصول إلى هوية محتملة عندما تكون وسائل التعرف الأخرى غير ممكنة. ويحتاج هذا النوع من التحقيقات إلى دقة عالية، لأن النتيجة قد تكون ذات أهمية كبيرة لعائلة الشخص المفقود وللإجراءات القانونية. لذلك يجب جمع العينات وحفظها وتحليلها وفق إجراءات علمية موثوقة. كما تمثل قواعد بيانات DNA أداة مهمة في بعض أنظمة تحديد المفقودين، حيث يمكن مقارنة الملفات الوراثية المجهولة بالملفات الموجودة في النظام وفق القوانين المعمول بها. وفي الختام، توفر الوراثة الجنائية وسيلة علمية مهمة لتحديد هوية الأشخاص المفقودين والرفات مجهولة الهوية. ويساعد التطور المستمر في تقنيات DNA على زيادة القدرة على تحليل العينات الصعبة، مع ضرورة الالتزام بالمعايير العلمية والخصوصية والضوابط القانونية.